Анализ ПЦР, что это?

В гинекологии мазок ПЦР входит в перечень обязательных диагностических процедур. Он позволяет выявить наличие половых инфекций и не требует длительного ожидания результатов. Мазок — это метод исследования, при котором врач берёт биологический материал с поверхности слизистых оболочек. Метод является малотравматичным и безболезненным, занимает мало времени и безопасен. Определение заболеваний с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР) обладает высокой точностью (до 99.6%) и специфичностью.

В каких случаях дают направление

В каких случаях дают направление

Этот вид исследования имеет сверхчувствительность и позволяет быстро получить результаты, что сделало ПЦР в гинекологии неотъемлемой частью диагностики в гинекологии. Врачи-урологи тоже часто прибегают к нему для постановки диагноза у мужчин.

Мазок ПЦР у женщин и мужчин выявляет:

  • наличие скрытых инфекций, передаваемых половым путём: хламидиоз, уреаплазмоз, микоплазмоз, трихомониаз, вирус герпеса, в том числе его онкогенные штаммы;
  • ВИЧ;
  • вирусы гепатита A , B, C, D;
  • вирусы краснухи, кори, паротита;
  • вирус Эбштейна — Барр и цитомегаловирус;
  • вирус папилломы человека;

Направление на обследование врач акушер-гинеколог даёт в следующих ситуациях:

  • планирование беременности;
  • тяжелое течение беременности, выкидыши в анамнезе
  • острая мочеполовая инфекция во время беременности или обострение уже имеющегося хронического заболевания;
  • незащищенный половой акт или наличие нескольких половых партнёров в течение последних 36 месяцев;
  • при подозрении на наличие ИППП у женщин, когда другие методы обследования никаких патологических изменений не выявили;

Мазок на ДНК-исследование берут из цервикального канала, заднего свода влагалища и уретры специальной щёточкой, которая не травмирует слизистые оболочки. Для получения точного результата важно, на какой день цикла вы пришли сдавать мазок на инфекции. Гинеколог заранее обговаривает, что на момент визита менструальные кровотечения должны закончиться, лучше всего сдавать анализ во второй половине менструального цикла.

После забора материала на ИППП у женщин, что в среднем составляет три минуты, весь собранный материал переносится в пробирку и помещается в специальный аппарат (амплификатор). Суть его работы состоит в нахождении участков генетического кода патологического агента и их копировании, дальнейшей идентификации, обработке информации и выдаче уже готовых результатов. Стоит отметить, что ещё один из плюсов — это возможность комплексной диагностики: при проведении теста может быть обнаружено несколько патологических агентов.

Применение ПЦР анализа

ВИЧ и полимеразная цепная реакция

Обследование на ВИЧ-инфекции проходят анонимно. В случае положительного ответа обследование повторяют и назначают дополнительно. Очень эффективен метод для обнаружения вируса, который вызывают эту болезнь.

Вирус гепатита С

Такой паразит, как вирус гепатита С, плохо определяется другими методами. ПЦР справляется с поставленной задачей хорошо. В случае подозрения на присутствие вируса гепатита С в организме человека ПЦР является оптимальным методом обследования, только она в состоянии распознать ласкового и замаскированного вредителя в крови и печени больного. Бывает, что вирус дремлет в печени и в кровь не поступает. В этом случае распознать его очень трудно. Ответ может быть даже отрицательный. Врачи, как правило, в таких случаях не останавливаются и ищут дальше: делают повторные анализы и не единожды. ПЦР может выявить вирусную частицу уже через одну-полторы недели. Чувствительность метода ПЦР для выявления вируса гепатита С составляет 97-98%.

ВПЧ (папилломавирусная инфекция)

Эта инфекция подвергает испытанию женский организм в первую очередь. Вирус любит женскую половую сферу и её органы. Если вы не проверяетесь — сознательно даёте волю вирусу атаковывать вас. Полимеразная цепная реакция обнаружит ДНК вируса, укажет, какой именно тип поселился в вашем организме. Вирус коварен, он долгое время не проявляет себя, не создавая дискомфорта. Бдительность хозяйки спит. Поэтому проверяйтесь, чтобы защитить себя от осложнений.

Венерические заболевания

Такие инфекции, как возбудители венерических заболеваний либо TORCH-инфекции, требуют внимания. В этом случае полимеразная цепная реакция может прийти на помощь, чтобы своевременно диагностировать и предупредить развитие последствий и осложнений. Но для диагностики венерических заболеваний существуют более доступные и дешёвые обследования.
Главное — не запускайте! Все эти микроорганизмы вредны и далеко не всегда их сразу можно выявить. При иммунодефиците ситуация осложняется и только беременность заставляет отнестись серьёзно, чтобы не повредить плоду.

Полимикробные инфекции

В случае с полимикробной инфекцией, которая включает патогенно-условных возбудителей, ПЦР приходит на помощь и выручает. Ей под силу обнаруживать скрытые инфекции.
Такой вредитель, как хламидия (крошечный паразит), прячется в клетке, умело искажает свой облик, ведёт себя очень осторожно, зато вред наносит большой и исподтишка. Она несёт опасность, как мужскому организму, так и женскому, вызывая заболевания разной степени тяжести. Распознать хламидию очень сложно. Метод ПЦР давно зарекомендовал себя, и ему доверяют. Тоже самое можно сказать обо всех инфекциях, передающихся половым путём. Нередко они встречаются в здоровом организме. Перед врачом стоит задача отличить здорового носителя от больного человека. В этом случае ПЦР — надёжный метод, ибо у данных микроорганизмов есть отличие в строении, поэтому другие исследования уступают и оказываются нерезультативными.

Герпес

С вирусом герпеса всё сложно. Встречаются люди, в организме которых этот вредитель прижился и не доставляет им никаких беспокойств, а также признаки заболевания отсутствуют. Поэтому не следует игнорировать назначенное обследование. В определённых случаях ПЦР можно считать обязательным методом диагностики, который способен защитить от грядущих осложнений не только женщину, но и её будущего ребёнка.

Полимеразная цепная реакция — метод, который служит людям более тридцати лет. Она помогает не только в нахождении и определении возбудителей серьёзных инфекций, но вносит свою лепту в развитие молекулярной биологии и неразрывно связана с такой наукой, как генетика. Кроме этого, сотрудничает с криминалистами, а в таких отраслях, как промышленность и сельское хозяйство, вносит весомый вклад и ощутимую пользу.

Реклама партнеров

Прочитали: 1 919

Правила подготовки для женщин и мужчин

Правила подготовки для женщин и мужчин

Достоверную информацию о наличии или отсутствии заболевания можно узнать, если соблюдать все правила подготовки к анализу. ПЦР мазок для анализа делают мужчинам и женщинам по направлению акушера, гинеколога или уролога. Материалом в данном случае служит соскоб из влагалища или уретры. В зависимости от целей диагностики на исследование забирают кровь, слюну или сперму.

Подготовка к сдаче ПЦР у мужчин и женщин во многом имеет общие черты, а также свои особенности:

  • минимум за 30 дней до сдачи анализа следует прекратить приём любых препаратов, влияющих на результат (антибиотики, противовирусные, противогрибковые, противопротозойные, иммуномодуляторы)
  • женщине записаться на приём к врачу нужно после месячных, не раньше, чем через 4-5 дней после последней менструации. Иногда возникают ситуации, при которых возникает вопрос: «Можно ли сдавать мазок во время месячных?». Гинекологи настоятельно не рекомендуют этого делать, чтобы избежать возможной инфекции и получить максимально точный результат;
  • за два дня до процедуры следует сохранять половой покой
  • подготовка к ПЦР начинается уже накануне — вечером необходимо принять ванну. Утром перед процедурой пользоваться душем нельзя, это снизит эффективность диагностических мероприятий.
  • последнее мочеиспускание должно быть минимум за 2- 2.5 часа перед процедурой
  • при сдаче крови запрещено употреблять пищу и пить жидкость

При соблюдении этих простых правил полученные мазки для ПЦР-исследования будут максимально информативными, и вам не придётся сдавать их вновь.

Сдача анализов ПЦР

Если вам интересно, как берут анализ ПЦР, то следует рассматривать каждый отдельный случай, учитывая тип биоматериала. Соскоб, мазок или забор крови имеет свои особенности, к примеру:

  • плазма сдается утром;
  • моча берется только первая утром, в лабораторных условиях в стерильный контейнер;
  • мазок или соскоб будет показателен только после воздержания от половых контактов не менее 3 суток;
  • нельзя сдавать мазок во время менструации и через 2 суток после нее.

Где сдать анализы на ПЦР

Данный вид исследования относится к современным и высокотехнологическим способам диагностики. Сдавать анализы методом ПЦР следует в лабораториях, которые обладают всем необходимым комплексом для получения полноценных результатов. Не меньшую роль играют квалифицированные, подготовленные кадры. Отдайте предпочтение крупными, серьезным, известным лабораториям. Это поможет не только получить результаты быстро, но и обеспечит их достоверность.

Цена

Еще один вопрос, который часто интересует пациентов: сколько стоит анализ ПЦР? Из-за новизны метода, необходимости приобретения дорогостоящего оборудования цена на тест относительно высокая. На стоимость ПЦР влияет вид инфекции, на которую будут проверять человека. Ориентировочная цена и сроки выполнения тестов следующая:

  1. ИППП проверят за 1 день, цена – 400-500 рублей.
  2. Герпес, ВПЧ, вирус Эпштейна-Барра, цитомегловирус выявляют за сутки, цена – 300-500 р.
  3. Анализ на гепатит проводится за 5 дней, цена на качественный вариант – 500 р., количественный – 2000 р.
  4. Хеликобактер пилори выявляют за сутки, цена – 400 р.
  5. Антигены, антитела ВИЧ, цена – от 380 р.
  6. Качественный анализ РНК ВИЧ, цена – от 3 500 р.
  7. Количественный анализ РНК ВИЧ, цена – от 11 000 р.

Мазок ПЦР при беременности

Мазок ПЦР при беременности

Проведение ПЦР при беременности необходимо в случаях подозрения на наличие возбудителей половых инфекций. Патогенные микроорганизмы могут распространяться вертикальным путём от матери к плоду через плаценту и вызывать у него различные аномалии развития, несовместимые с жизнью. Все диагностические мероприятия в акушерстве направлены на раннее выявление и лечение урогенитальной инфекции, поэтому здесь незаменимым методом становится полимеразная цепная реакция.

Многие будущие мамы боятся проведения манипуляции, ссылаясь на то, что может случиться выкидыш. Это связано с непониманием того, как берётся ПЦР-мазок у беременных женщин. При взятии материала из влагалища или уретрального канала нет никакой угрозы ни для матери, ни для плода: биологический материал аккуратно забирается со слизистой оболочки специальной щёткой без повреждения тканей. Обследование обладает высокой диагностической ценностью для исключения инфекционной патологии у беременных. Оно проводится в качестве скрининга при первом обращении к гинекологу, потом при необходимости назначаются повторные исследования. Правила сдачи ничем не отличаются от установленных для всех, сдавать мазок на ПЦР можно даже на поздних сроках вынашивания ребёнка.

Что такое ПЦР диагностика

Не стоит путать ПЦР с отдалённо похожим обследованием — ИФА. Поясним: иммуноферментный анализ ищет следы пребывания микроорганизмов, ПЦР находит логово возбудителя — среду, где рождаются чуждые человеческому телу микробы.

Для обследования подойдёт любой материал: венозная кровь, мокрота, слюна, выделения из половых путей. Врач предполагает ту ли иную патологию у больного, поэтому определяет, какой материал для обследования будет более информативным. Право выбора — за ним.

Использование ПЦР-диагностики производится в комплексе с другими методами исследования, такими как ИФА, ПИФ, РИФ и т.п. Их сочетание и целесообразность определяет врач. Одним из преимуществ метода является высокая чувствительность – от 95 до 100%. ПЦР используется в гинекологии, акушерстве, педиатрии, урологии, венерологии, неврологии и др.

Этапы ПЦР:

  • подготовка материала для копирования;
  • объединение генетического материала и реактивов;
  • копирование генетического материала возбудителя инфекции.

Суть проведения полимеразной цепной реакции

Очень важно взять чистый материал без примесей и проводить обследование аккуратно, строго соблюдая правила.

Итак, фрагмент ДНК найден, однако в наличии он один. Для проведения обследования этого недостаточно, нужно сделать копию. Для успешного проведения обследования требуется много таких фрагментов.

Задача усложняется, ведь исследователю требуется создать ту среду обитания, в которой микроорганизм станет размножаться. В процессе клонирования будут достраиваться идентичные фрагменты участки ДНК. В этом принимает участие фермент полимераза.

С её помощью вне живого организма в обычной пробирке с пробкой произойдёт образование клонов. В этом случае можно сказать, что цепная реакция состоялась. Исследователь следит, чтобы клонировались только выбранные им фрагменты.

ПЦР — умное исследование. В том случае, если среди миллионов частичек в вашем организме заведётся один чужак, она легко его обнаружит и ответит положительно. В этом заключается достоинство обследования.

Если у больного не наблюдается никакой симптоматики, а результат ПЦР положительный, решение остаётся за врачом. Следует добавить, что необходимо учитывать высокую чувствительность ПЦР-системы, она способна обнаруживать возбудителя даже в доклинической стадии. В этом заключается преимущество этой процедуры.

Лечащий врач взвешивает все факторы и принимает решение в отношении целесообразности лечения.

Как сдавать и через сколько готов результат

Как сдавать и через сколько готов результат

Большинство посетителей клиники испытывает лёгкий страх перед тем, как сдавать анализы. Процедура является полностью безопасной и безболезненной, количество осложнений при её проведении стремится к нулю.

Забор для лабораторной диагностики проводится по предварительной записи, ведь к визиту врача необходимо подготовиться. Легче всего подготовиться к анализу крови, никаких ограничений здесь нет.

Сдача крови осуществляется натощак, забор материала происходит из вены в объеме до 10 мл. Мазок методом ПЦР делают со слизистых шейки матки (из цервикального канала), уретры и влагалища.

Каждое предметное стекло маркируется в зависимости от отдела, откуда брали материал, латинскими буквами C, V, U и направляется в лабораторию. Сколько будет готовиться результат во многом зависит от лаборатории и её загруженности. В среднем, срок составляет двое суток. В экстренных случаях время выполнения может сократиться до нескольких часов.

Проверка на ВИЧ

У ДНК-анализа не ВИЧ имеется несколько специфических особенностей и рекомендаций:

  1. Если произошел нежелательный контакт с ВИЧ инфицированным человеком, то анализы на проведение диагностики необходимо сдавать не ранее 14 суток, после него.
  2. Во время проведения диагностирования в образце происходит поиск не ДНК-вируса, а клеток им уже поврежденных. Эти клетки несут в себе специфическую вирусную информацию, которая самокопируется в незаражённые клетки.
  3. Хоть синдром иммунодефицита и остаётся одной из самый опасных болезней. Но, период истерии средств массовой информации по её поводу сильно омрачил её, и без того опасные особенности. Заразность даже при попадании инфицированной крови в кровь здоровую составляет 85%, что много не 100%. При прочих же контактах она составляет не более чем от 1% до 10%.
  4. Сроки получения готовых результатов анализов находятся в пределах от 4 до 7 дней.

Правила расшифровки результатов

Правила расшифровки результатов

Неоспоримым преимуществом метода ПЦР является его доступность, сверхточный анализ мазка и исключение ложноположительных и ложноотрицательных тестов. Все возбудители половых инфекций идентифицируются данным исследованием, вероятность ошибки составляет менее 0.5%.

ПЦР-анализ позволяет определить минимальные содержания вируса в организме. Сам аппарат распознает единичные фрагменты ДНК или РНК и многократно их копирует в пробирке, затем анализирует и выдает результат на бумагу. Если процесс копирования (репликации) генома вируса прошёл успешно, то результат будет положительным. Отрицательный же тест подтверждает отсутствие генетических структур в организме, а следовательно, и отсутствие заболеваний.

Преимущества методики ПЦР

Всего разработано более 10 разных методик амплификации, применяемых лабораториями в зависимости от исходных условий и поставленных целей.
Общим для них есть высокая чувствительность (для положительного результата достаточно 40 (!) или менее искомых копий ДНК в 1 мл образца, то есть вероятность ложноотрицательного ответа ничтожно мала. И очень высокая специфичность: вероятность ложноположительного ответа составляет менее 1%.
Но точность результатов сильно зависит от качества сбора диагностического материала, тщательного соблюдения всех технических требований к каждому этапу и качеству оборудования, расходных материалов (буфера, праймеров, раствора для отмывки и т.д.).

О результатах и ценах

Результаты исследования можно получить на следующий день. Количественный показатель, иначе, число полученных копий инфекционного агента, указывается редко. В большинстве случаев пациент получает бланк с качественной интерпретацией результата. Варианты могут быть:

  • «обнаружено» или «положительно» — наличие инфекционного заболевания;
  • «не обнаружено» или «отрицательно» — отсутствие заражения.

Положительный результат при отсутствии выраженных проявлений болезни свидетельствует о латентном бессимптомном течении инфекции или пребывании возбудителя в стадии инкубации. Исследование относится к средней ценовой категории.

В клиниках Москвы и других крупных городов стоимость определения одного вида инфекции варьируется от 300 до 500 руб. Комплексный анализ ПЦР-12, как правило, обходится дешевле, чем проверка на каждый возбудитель отдельно.

Плюсы и минусы

Как и большинства сложных и высоких технологий, у полимеразного метода присутствуют, как достоинства, так и недостатки. В двух слова;

Из полюсов:

  1. Превосходная точность результатов исследования. Если вся технология соблюдена в точности, то вероятность ошибки в результатах стремится к сотым долям процента.
  2. Обширный выбор материалов для анализа. Полимеразная цепная реакция позволяет извлечь из образца любой генетический материал, который может в нём содержаться. Благодаря этому можно с равным успехом исследовать образцы слюны, крови, волос (с луковицами), ногтей, окурков от сигарет т.д.
  3. Сверхраннее диагностирование. Других универсальных методик способных обнаружить любую известную инфекцию на ранней стадии, до возникновения симптомов инфекционного заболевания, нет. Эта же методика, позволяет обнаружить дремлющие наследственные болезни, которые проявляют себе в разных поколениях по разному.
  4. Один метод ПЦР породил множество тестов, отвечающих разным тематикам исследований во многих отраслях человеческой деятельности.

Из Минусов:

  1. Высокая стоимость. Конечно тестов много, и стоят они по-разному, но самые информативны исследования всё ещё стоят не дешево. Но стоит учитывать, что всего за пару десятилетий технология сделала скачек стоимости в 100.000$ за полное исследование ДНК одного человека в лаборатории США, до ценника в районе 20-30 тысяч рублей в вашем или соседнем городе.
  2. Нехватка специалистов высокого уровня профессиональной подготовленности. Отчасти это сказывается и на конечной стоимости тестирования – генетика отрасль относительно молодая и развивающаяся. Общество не успевает изменяться под новые потребности в специалистах, как и само медленно привыкает к новым услугам и инновациям.
  3. Результаты теста будут искаженны, если образец для исследования был случайно или намеренно загрязнён. Тот момент, когда в очередной раз кажется, что безупречность почти достигнута. Но точность анализа настолько высока, что это является её плюсом и минусом одновременно.

Кому нужна диагностика

Поскольку ПЦР позволяет выявить даже мигрирующие из поколения в поколение наследственные заболевания в их скрытой фазе, провести такое исследование наверно будет полезно каждому. Конечно, не всем такие знания кажутся насущными и необходимыми здесь и сейчас, Но, думается, что по мере развития цивилизации будут расти и успехи медицины и генетики. А новые открытия позволят далеко продвинуться в достижении долголетия и здоровья. К тому момент, тест на наследственность вполне может стать обыденным и обязательным для всех анализом.

Пока же этого не случилось, чаще всего тест необходим в таких случаях:

  1. При возникновении подозрений о получение заболевания половым путем, или через укол, попадание зараженной крови на слизистые или открытые раны (достаточно небольшого пореза), нападение диких и одичавших животных, случайная травма об окружающие предметы, например, наступить в поле на старый гвоздь.
  2. Для уточнения диагноза, сделанного иными средствами, особенно в случаях, когда лечение даёт не специфическую реакцию организма.
  3. Для установления родственных связей для заявления прав на наследство, или в алиментной тяжбе.
  4. Для идентификации личности человека.

Остальные тестирование больше относятся к сферам индивидуальных интересов. Кому интересно узнать, что показывает расшифровка всех народностей в его роду. Кто-то пытается планировать будущего ребенка и тестируется на совместимость. Кто-то решил заменить ДНК-тестом диетолога, и получить индивидуальные инструкции, советы по правильному питанию.

Специфика

Специфика всех тестов на основе метода обследования ПЦР в том, что его результаты не могут быть ложноположительными. То есть, если результаты анализа говорят о присутствие ДНК возбудителя болезни, оно точно имеется в пробе. Но из-за такой точности при несоблюдении всего технологического процесса в стерильных условиях, есть риск понести расходы на исследование и провалить его, когда загрязнение будет обнаружено и определено. Что выявляет некоторую слабость методики.

Поэтому, лучше всего обращаться за ДНК-тестирование в специализированную клинику со своей собственной хорошо оборудованной лабораторией. Создание таких учреждений происходит с большими вложениями, как в оборудование, так и в квалифицированный персонал.

5663 10 Октября

ВАЖНО!

Информацию из данного раздела нельзя использовать для самодиагностики и самолечения. В случае боли или иного обострения заболевания диагностические исследования должен назначать только лечащий врач. Для постановки диагноза и правильного назначения лечения следует обращаться к Вашему лечащему врачу.

В конце статьи см. словарь
Полимеразную цепную реакцию (ПЦР, PCR) изобрёл в 1983 году Кэри Мюллис (американский учёный). Впоследствии он получил за это изобретение Нобелевскую премию. В настоящее время ПЦР-диагностика является, одним из самых точных и чувствительных методов диагностики инфекционных заболеваний.
Полимеразная цепная реакция (ПЦР) — экспериментальный метод молекулярной биологии, способ значительного увеличения малых концентраций определённых фрагментов нуклеиновой кислоты (ДНК) в биологическом материале (пробе).
В основе метода ПЦР лежит многократное удвоение определённого участка ДНК при помощи ферментов в искусственных условиях (in vitro). В результате нарабатываются количества ДНК, достаточные для визуальной детекции. При этом происходит копирование только того участка, который удовлетворяет заданным условиям, и только в том случае, если он присутствует в исследуемом образце.
Кроме простого увеличения числа копий ДНК (этот процесс называется амплификацией), ПЦР позволяет производить множество других манипуляций с генетическим материалом (введение мутаций, сращивание фрагментов ДНК), и широко используется в биологической и медицинской практике, например, для диагностики заболеваний (наследственных, инфекционных), для установления отцовства, для клонирования генов, введения мутаций, выделения новых генов.

Специфичность и применение
ПЦР — метод молекулярной диагностики, ставший для ряда инфекций «золотым стандартом», проверен временем и тщательно апробирован клинически. Метод ПЦР позволяет определить наличие возбудителя заболевания, даже если в пробе присутствует всего несколько молекул ДНК возбудителя.
ПЦР позволяет диагностировать наличие долго растущих возбудителей, не прибегая к трудоёмким микробиологическим методам, что особенно актуально в гинекологии и урологии при диагностике урогенитальных инфекций, передающихся половым путем (ИППП).
Также, этим методом проводят диагностику вирусных инфекций, таких как гепатиты, ВИЧ и др. Чувствительность метода значительно превосходит таковую у иммунохомических и микробиологических методов, а принцип метода позволяет диагностировать наличие инфекций со значительной антигенной изменчивостью.
Специфичность ПЦР при использовании технологии PCR даже для всех вирусных, хламидийных, микоплазменных, уреаплазменных и большинства других бактериальных инфекций достигает 100%. Метод ПЦР позволяет выявлять даже единичные клетки бактерий или вирусов. ПЦР-диагностика обнаруживает наличие возбудителей инфекционных заболеваний в тех случаях, когда другими методами (иммунологическими, бактериологическими, микроскопическими) это сделать невозможно.
Особенно эффективен метод ПЦР для диагностики трудно культивируемых, некультивируемых и скрыто существующих форм микроорганизмов, с которыми часто приходится сталкиваться при латентных и хронических инфекциях, поскольку этот метод позволяет избежать сложностей, связанных с выращиванием таких микроорганизмов в лабораторных условиях.
Применение ПЦР-диагностики также очень эффективно в отношении возбудителей с высокой антигенной изменчивостью и внутриклеточных паразитов. Методом ПЦР возможно выявление возбудителей не только в клиническом материале, полученном от больного, но и в материале, получаемом из объектов внешней среды (вода, почва и т. д.). В урологической и гинекологической практике — для выявления хламидиоза, уреаплазмоза, гонореи, герпеса, гарднереллёза, микоплазменной инфекции, ВПЧ — вирусов папилломы человека; в пульмонологии — для дифференциальной диагностики вирусных и бактериальных пневмоний, туберкулёза; в гастроэнтерологии — для выявления хеликобактериоза; в клинике инфекционных заболеваний — в качестве экспресс-метода диагностики сальмонеллёза, дифтерии, вирусных гепатитов В, С и G; в гематологии — для выявления цитомегаловирусной инфекции, онковирусов.
Специфичность ПЦР основана на образовании комплементарных комплексов между матрицей и праймерами — короткими синтетическими олигонуклеотидами длиной 18 — 30 букв. Каждый из праймеров сопоставим (комплементарен) с одной из цепей двуцепочечной матрицы, обрамляя начало и конец амплифицируемого участка.
После соединения (гибридизации) матрицы с праймером (отжиг), последний служит затравкой для ДНК-полимеразы при синтезе комплементарной цепи матрицы.
Проведение ПЦР
Для проведения ПЦР в простейшем случае требуются следующие компоненты:

  • ДНК-матрица, содержащая тот участок ДНК, который требуется амплифицировать;
  • два праймера, комплементарные концам требуемого фрагмента;
  • термостабильная ДНК-полимераза;
  • дезоксинуклеотидтрифосфаты (A, G, C, T);
  • ионы Mg2+, необходимые для работы полимеразы;
  • буферный раствор.

ПЦР проводят в амплификаторе — приборе, обеспечивающем периодическое охлаждение и нагревание пробирок, обычно с точностью не менее 0,1°C. Чтобы избежать испарения реакционной смеси, в пробирку добавляют высококипящее масло, например, вазелиновое. Добавление специфичеких ферментов может увеличить выход ПЦР-реакции.
Ход реакции
Обычно при проведении ПЦР выполняется 20 — 35 циклов, каждый из которых состоит из трех стадий. Двухцепочечную ДНК-матрицу нагревают до 94 — 96°C (или до 98°C, если используется особенно термостабильная полимераза) на 0,5 — 2 минуты, чтобы цепи ДНК разошлись. Эта стадия называется денатурацией — разрушаются водородные связи между двумя цепями. Иногда перед первым циклом проводят предварительный прогрев реакционной смеси в течение 2 — 5 минут для полной денатурации матрицы и праймеров.
Когда цепи разошлись, температуру понижают, чтобы праймеры могли связаться с одноцепочечной матрицей. Эта стадия называется отжигом. Температура отжига зависит от праймеров и обычно выбирается на 4 — 5°С ниже их температуры плавления. Время стадии — 0,5 — 2 минут.
ДНК-полимераза реплицирует матричную цепь, используя праймер в качестве затравки. Это — стадия элонгации. Температура элонгации зависит от полимеразы. Часто используемые полимеразы наиболее активны при 72°C. Время элонгации зависит как от типа ДНК-полимеразы, так и от длины амплифицируемого фрагмента. Обычно время элонгации принимают равным одной минуте на каждую тысячу пар оснований. После окончания всех циклов часто проводят дополнительную стадию финальной элонгации, чтобы достроить все одноцепочечные фрагменты. Эта стадия длится 10 — 15 мин.
Подготовка материала к исследованию и транспорт его в лабораторию
Для успешного проведения анализа важно правильно собрать материал у пациента и правильно провести его подготовку. Известно, что в лабораторной диагностике большинство ошибок (до 70%) совершается именно на этапе пробоподготовки. Для взятия крови в лаборатории ИНВИТРО в настоящее время применяются вакуумные системы, которые с одной стороны минимально травмируют пациента, а с другой — позволяют произвести взятие материала таким образом, что он не контактирует ни с персоналом, ни с окружающей средой. Это позволяет избежать контаминации (загрязнения) материала и обеспечивает объективность анализа ПЦР.
Словарь
ДНК – дезоксирибонуклеиновая кислота — биологический полимер, один из двух типов нуклеиновых кислот, обеспечивающих хранение, передачу из поколения в поколение и реализацию генетической программы развития и функционирования живых организмов. Основная роль ДНК в клетках — долговременное хранение информации о структуре РНК и белков.
РНК– рибонуклеиновая кислота — биологический полимер, близкий по своему химическому строению к ДНК. Молекула РНК построена из тех же мономерных звеньев — нуклеотидов, что и ДНК. В природе РНК, как правило, существует в виде одиночной цепочки. У некоторых вирусов РНК является носителем генетической информации. В клетке играет важную роль при передаче информации от ДНК к белку. РНК синтезируется на ДНК-матрице. Процесс этот называется транскрипцией. В ДНК имеются участки, где содержится информация, ответственная за синтез трех видов РНК, различающихся по выполняемым функциям: информационной или матричной РНК (мРНК), рибосомальной (рРНК) и транспортной (тРНК). Все три вида РНК тем или иным способом участвуют в синтезе белка. Однако информация по синтезу белка содержится только в мРНК.

Нуклеоти́ды — основная повторяющаяся единица в молекулах нуклеиновых кислот, продукт химического соединения азотистого основания, пятиуглеродного сахара (пентозы) и одной или нескольких фосфатных групп. Нуклеотиды, представленные в нуклеиновых кислотах, содержат одну фосфатную группу. Они называются по содержащемуся в них азотистому основанию — адениновый (A), содержащий аденин, гуаниновый (G) — гуанин, цитозиновый (C) — цитозин, тиминовый (Т) — тимин, урациловый (U) — урацил. В состав ДНК входят 4 типа нуклеотидов — A, T, G, C, в состав РНК также 4 типа — A, U, G, C. Сахаром в составе всех нуклеотидов ДНК является дезоксирибоза, РНК — рибоза. При образовании нуклеиновых кислот нуклеотиды, связываясь, образуют сахаро-фосфатный остов молекулы, по одну сторону которого находятся основания.
Праймер – котроткая ДНК, используемая для репликации матричной цепи. Каждый из праймеров комплементарен одной из цепей двуцепочечной матрицы, обрамляя начало и конец амплифицируемого участка.
Литература

ВАЖНО!

Информацию из данного раздела нельзя использовать для самодиагностики и самолечения. В случае боли или иного обострения заболевания диагностические исследования должен назначать только лечащий врач. Для постановки диагноза и правильного назначения лечения следует обращаться к Вашему лечащему врачу.

Области применения анализа

В настоящее время в медицине и криминалистике, а также для клонирования генов и установления родственных связей применяют более десятка разновидностей амплификации. В ежедневной практике кровь на ПЦР назначают медицинские специалисты:

  • педиатр;
  • гинеколог;
  • уролог;
  • дерматовенеролог;
  • инфекционист;
  • фтизиатр;
  • пульмонолог.

Генно-молекулярная диагностика успешно применяется в неонатологии. С помощью полимеразной цепной реакции выявляют возможное заражение младенцев внутриутробно и сразу после появления на свет. Для детей с риском инфицирования анализ проводят в первые 48 часов после рождения и повторно в возрасте 3-6 месяцев.

Кроме инфекционных заболеваний, Рolymerase Сhain Reaction помогает диагностировать наследственные аномалии и мутации. В перинатальный период методом ПЦР у будущего малыша можно обнаружить:

  • гемофилию – нарушение свертываемости крови;
  • болезнь Хантера – патологии обменных процессов;
  • мусковидоз – нарушение внешнесекреторной функции желез;
  • нервно-мышечную миодистрофию Дюшенна-Беккера;
  • первичный иммунодефицит;
  • синдром Альпорта – патологию почек.

PCR используют для определения мутантных генов и их РНК-продуктов в диагностике онкологических заболеваний. Высокая чувствительность молекулярного метода обеспечивает выявление онкопатологий в доклинической стадии, когда очаг опухоли не превышает 0,01 см3 в размерах.

По обнаруженным онкогенам, биологическим канцерогенам и антионкогенам диагностируют исходную стадию:

  • онкогематологических болезней (рака крови и лимфатической системы);
  • злокачественных образований молочных желез;
  • аденокарциномы толстой кишки;
  • меланомы;
  • рака ротоглотки;
  • наследственных форм рака.

Высокой онкогенностью обладают штаммы 16, 18, 31, 33, 35 ВПЧ (вируса папилломы человека). В 50% случаев вызывают карциному шейки матки у женщин – раковую опухоль эпителиальных клеток. Обнаружение неопластических клеток в доклинической стадии рака значительно повышает шансы на успешное лечение болезни.

Особую ценность ПЦР имеет для Службы крови. Метод позволяет определить заражение гепатитами, ВИЧ, сифилисом в бессимптомный инкубационный период. На этой стадии иммунная система еще не продуцирует антитела к возбудителям, и выявить заболевания с помощью серологических исследований невозможно.

Проверка донорской крови ПЦР предупреждает возможное инфицирование реципиента

Спектр возможностей ПЦР в диагностике инфекций

Анализ полимеразной цепной реакции крови используется для выявления ЗППП (заболеваний, передающихся половым путем) и урогенитальных инфекций, инфекционных болезней легких, печени, пищеварительной системы, так называемых, детских болезней.

Краткий перечень возбудителей и заболеваний, определяемых по крови, мазку и моче

Вирусы
герпесовирус 1 тип обычный герпес
2 тип генитальный герпес
3 тип краснуха
4 тип (цитомегаловирус) цитомегалия
5 тип (Эпштейн-Барр) инфекционный мононуклеоз
папилломы человека (21 штамм) папилломатоз
HAV, HBV, HCV гепатит А, В, С
иммунодефицита ВИЧ, СПИД
Бактерии
бледная трепонема сифилис
гарднереллы гарднереллез
гонококки гонорея
уреаплазма уреаплазмоз
сальмонелла сальмонеллез
палочка Коха туберкулез
листерия листериоз
стрептококки и стафилококки сепсис, пневмония, менингит
Паразиты, прокариоты, простейшие
описторхи (печеночные сосальщики) описторхоз
плазмодий малярия
токсоплазма токсоплазмоз
лямблии лямблиоз
хламидии хламидиоз
трихомонада трихомониаз
микоплазма микоплазмоз
эхинококки эхинококкоз
шистосомы шистосомоз
цестоды альвеококкоз

Комплексный анализ на ЗППП носит название «профиль ПЦР-12», по количеству определяемых возбудителей. В профиль входят половые инфекции:

  • хламидиоз;
  • гонорея;
  • трихомониаз;
  • сифилис;
  • ВИЧ;
  • обычный и генитальный герпес;
  • цитомегалия и инфекционный мононуклеоз;
  • папилломатоз;
  • гепатиты В, С.

А также микоплазмоз и уреаплазмоз – не относящиеся к венерическим болезням, но передающиеся при интимной близости. Отдельный анализ крови ПЦР на кандидоз (молочницу) практикуется редко, поскольку заболевание легко выявляется по мазку из влагалища (у мужчин из уретры).

Показания к проведению ПЦР-12

Прямыми показаниями являются симптоматические проявления, характерные для половых инфекций:

  • длительная фебрильная (38-39 ℃) температура тела;
  • увеличение лимфатических узлов;
  • кожная сыпь;
  • зудящие высыпания в области наружных половых органов;
  • поллакиурия (учащенное мочеиспускание), сопровождающаяся жжением в уретре;
  • боли в нижней части живота, иррадиирующие в поясницу;
  • диспареуния (болезненные ощущения во время интимной близости и после секса);
  • лейкоррея у женщин (неспецифические влагалищные выделения с неприятным запахом) и выделение слизи из уретры у мужчин.

ПЦР-12 рекомендовано пройти при планировании беременности.

Основные симптомы и осложнения половых инфекционных заболеваний

Материалом для осуществления ПЦР-диагностики могут служить

  • Эпителиальные соскобы со слизистых оболочек. Обычно используются для диагностики заболеваний, передающихся половым путем (ЗППП), таких как гонорея, хламидиоз, микоплазмоз, уреаплазмоз, трихомониаз, гарднереллез, герпетическая и другие инфекции, поражающие слизистые оболочки.
  • Моча. Моча может использоваться при инфекционном поражении мочеполового тракта у мужчин и мочевыделительных органов у женщин (у мужчин использование в качестве материала мочи заменяет эпителиальный соскоб).
  • Мокрота. Мокрота используется для диагностики туберкулеза и реже для диагностики респираторных форм хламидиоза и микоплазмоза. Мокроту в количестве 15-20 мл собирают в стерильный (одноразовый) флакон.
  • Кровь, плазма, сыворотка. Используются для ПЦР анализа вирусов гепатитов B, C, D, G, герпеса, ЦМВ, ВИЧ, исследования генов человека.
  • Биологические жидкости. Сок простаты, плевральная, спинномозговая, околоплодная, суставная жидкость, бронхоальвеолярный лаваж, слюна забираются по показаниям.
  • Биоптаты. Чаще всего используют биоптаты желудка и двенадцатиперстной кишки для выявления хеликобактерной инфекции.

Стоимость ПЦР анализа в нашем медцентре

Подготовка материала

Главное при подготовке биоматериала для анализа это собрать его желательно в более стерильном виде — без посторонних примесей. Для этого имеются рекомендации к гигиеническому графику, употребления фармакологических веществ и прочие.

Похожие требования и к транспортировке проб – они должны быть упакованы в подходящие для этого чистые контейнеры, и в некоторых случаях, так же требуется соблюдение особого теплового режима хранения.

Сдача анализов

Анализ методом ПЦР требует особой аккуратности. Поскольку главное требование всей процедуры это идеально чистый образец для пробы, многие анализы сдаются непосредственно в клинике: кровь, другие физиологические жидкости, иногда ткани.

Самый простой метод сбора биоматериала это сбор слюну с внутренней полости рта на ватную палочку. Способ прост, выполняется на дому, но подходит не для всех тестов.

Отдельно протекает подготовка нестандартных образцов, что индивидуально и лучше проконсультироваться у клиники, в каком прядке она их примет.

Подготовка у мужчин

У мужчин нет особенностей при сдаче анализов на различные тесты. Но, в случае тестирование на наличие половых инфекций рекомендуется повышенная интимная гигиена, не менее пары суток воздержания, и не справлять естественные малые потребности за трое часов до процедур.

Подготовка у женщин

Для женщин наставлений, запретов и рекомендаций к сдаче несколько больше:

  • Не переусердствовать с интимной гигиеной и не использовать мыла с антибиотиками.
  • Вообще любой прием антибиотиков более чем за 4 недели до сдачи анализов запрещён.
  • Имеются запреты и на специфические интимные средства. Поэтому, для верности соблюдения допусков проще ограничиться стандартной гигиеной. И ограничиться желательно за месяц до сдачи анализов.
  • Запрещена сдача анализов в особо острые дни месячных женских циклов.
  • Запрещаются близкие интимные контакты за 48 часов до проведения процедур.

Добавить комментарий

Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *